崔玄暐年轻时以学行著称，深受叔父秘书监崔行功器重。662年(龙朔二年)，崔玄暐考中明经科，累迁至库部员外郎，后授天官郎中、凤阁舍人。701年(长安元年)，崔玄暐升任天官侍郎。他性情耿直，从不私下接受官员请托，因此受到权贵的忌恨，改任文昌左丞
